Malik Zidi obtient son premier rôle dans Les Corps ouverts (Sébastien Lifshitz, 1996) puis est remarqué dans Place Vendôme, de Nicole Garcia (1998). Il joue ensuite dans Gouttes d’eau sur pierres brûlantes, de François Ozon (1999). Résolument tourné vers le cinéma indépendant, il brille aussi bien devant les caméras de cinéastes chevronnés tels Téchiné (Les Temps qui changent, 2004), Ruiz (Mystères de Lisbonne, 2010) ou Doillon (Un Enfant de toi, 2011) qu’aux côtés des jeunes auteurs que sont Emmanuel Bourdieu (Les Amitiés maléfiques, 2006, César du Meilleur Espoir Masculin) ou Sophie Fillières (Un chat un chat, 2009). Il s’aventure aussi avec de grands metteurs en scène internationaux comme Hugo Santiago (Le Ciel du centaure, 2015) ou Kiyoshi Kurosawa (Le Secret de la chambre noire, 2016).
Malik Zidi découvre aussi l’univers des séries à travers Les Thibault, avec Jean Yanne (2003) et Nox (2018) en compagnie de Nathalie Baye.
En 2019, il est à l’affiche de deux comédies : Tout ce qu’il me reste de la révolution (Judith Davis) et Play (Anthony Marciano). Vers la bataille d’Aurélien Vernhes-Lermusiaux, sortira en fin d’année. Il est actuellement sur le tournage pour Netflix de O2 (Alexandre Aja).
Début 2020, Malik Zidi publie son premier roman, L’Ombre du soir (Éditions Anne Carrière).